J'avais exactement le même soucis que toi sur le 7D avec le 50mm f/1.4, le type de décalage variait avec la distance, utilisant principalement cet objectif vers 2m j'ai donc micro-réglé à +15 (oui, +15...) pour cette distance et c'était pas trop mal (du coup le reste bof).
Je n'avais le soucis qu'avec mes 50mm (1.8 et 1.4), certainement visible du fait de la faible profondeur de champ. Et pourtant j'utilisais majoritairement le collimateur central.

En revanche depuis que j'ai le 5D II c'est du quasi-parfait en permanence à f/1.4, je n'ai pratiquement plus de déchets avec ce boitier et ce quelle que soit l'objectif utilisé. Son AF n'est peut-être pas un modèle de réactivité ni d'actualité mais en tout cas il est redoutablement précis même en basse lumière pour peut que l'on utilise le collimateur central, du coup MR à 0 sur le 50.