Sous linux, tes options sont :
- gimp, mais pas de traitements 16 bits
- cinepaint : issu de gimp, et gère le 16 et 32 bits, mais interface a mon avis pourrie...
- krita : gère le 16 bits mais très lent

Au niveau derawtiseur, tu as :
- bibble, qui est sans doute la meilleure alternative sous linux
- ufraw, qui a un plugin pour gimp et depuis la dernière version pour cinepaint, une bonne alternative
- rawtherapee, un logiciel qui monte, pas mal d'atouts, mais plus limité que bibble
- digiKam : l'intégration de dcraw laisse encore a désirer (mais j'y bosse un peu, quand j'ai du temps à consacrer à la prog, c'est l'un des avantages du logiciel libre ), par contre, il a quelques outils ensuite qui sont assez géniaux (le plugin de mise au point par exemple est assez exceptionnel !). Il gère le 16bits

Je dois dire que quand même, étant sous linux, s'il devait y avoir un seul logiciel, ça serait... lightroom, qui malheureusement ne tourne pas sous linux :'( Bibble est très bon, mais Lightroom est quand meme un cran au dessus. J'attends de voir la version 5 de bibble qui ne devrait plus tarder, ça risque de compenser le manque !