Ne pas mettre les batteries Lithium-Ion en décharge profonde a toujours été le cas pour cette technologie. D'ailleurs les circuits de protection intégrés dans les packs batterie (et également dans les téléphones) sont là pour mettre la batterie hors circuit à partir d'un certain niveau de décharge.
Ce que vous nommez les "anciennes batteries" sont les technologies Ni-Cd et NiMH qui elles présentaient un effet mémoire et il était effectivement recommandé d'avoir des cycles de charge et décharge complets.