Le 5DIII est au dessus, aucun doute là dessus. En revanche, vaut-il le double du 6D, c'est une toute autre question...
Si tu as absolument besoin de l'AF de compétition, alors pas de doute, part sur le 5DIII. Mais si un colli central ultra-performant (meilleur même que sur le 5DIII) te suffit accompagné de quelques autres, je pense que les autres petites différences ne feront pas le poids face aux 1300€ économisés (et le cashback actuel de 200€ sur le 6D ne va pas inverser la tendance :p)