Je ne suis pas un expert, loin de là...
Mais je vais essayer d'apporter quelque compléments.

1) Comme le dit Oeidetaup, en mode Av (comme en mode Tv d'ailleurs), l'appareil définit le couple diaphragme / temps de pose comme s'il n'y avait pas de flash. Il calcule ensuite la puissance du flash pour éclairer le premier plan. Autrement dit c'est du fill-in.
Nota : l'autofocus n'a rien à voir là-dedans...

2) Pour que la flash soit prédominant en mode Av il faut régler la fonction C.Fn-2 sur les valeurs 1 ou 2 (voir page 218 du manuel) pour limiter la plage de vitesse.
Tu peux aussi mettre le boîtier en mode M et choisir diaphragme et vitesse à ta convenance. Le flash assurera l'éclairage (dans les limites de ses capacités, évidemment).

3) Concernant les 2 modes de mesure d'eposition au flash, je laisse moi aussi la place...
Personellement j'utilise toujours la mesure évaluative, éventuellement avec une correction d'exposition.

Edit : grillé par rem22...