Personnellement je trouve que le 40D plus discret que le 400D, mais je ne connais pas celui du 300D.

Pour en revenir à ta question, en théorie tu seras assez loin des animaux et couvert par le bruit ambiant.
Sinon, il existe des housses qui étouffent le bruit du déclenchement, et accessoirement qui protègent le boitier.
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"Une astuce (outre l'achat d'une housse anti-bruit) consiste à se confectionner soit-même un système pour isoler le bruit de déclenchement (une bonne vieille "housse" en anorak épais isole assez bien et camoufle le bruit sec et aigu du déclenchement !)"