J'ai eu le 50d, je l'ai acheté alors que le 60d était déjà disponible.
J'ai préféré le 50d pour des tas de raisons, mais pour répondre à ta question, c'est principalement le capteur plus récent (meilleure montée iso) et l'écran orientable les avancées du 60d.

Dans le "recul" du 60d qui m'a fait ne pas le prendre : l'absence de microréglage (bon courage pour les optiques fixes lumineuses), la construction moins flatteuse (peu utile cependant), les cartes SD au lieu de CF, surtout l'absence de joystick (sélection à la volée du collimateur, c'est géniale), la roue codeuse qui a été remplacé par un truc bizarre