Merci pour vos réponses.

Comme le conseille belnea, j'ai lancé la réparation des autorisations : cela ne résout pas le problème.
J'ai la dernière version de Lion (10.7.5, installée avant de faire la mise à jour d'Aperture) et ne souhaite pas passer sur Mountain Lion.

Après avoir consulté des sites Apple, il semble que la solution soit effectivement de désinstaller et réinstaller Aperture.

C'est quand même malheureux de diffuser une MAJ avec un tel bug ...