Pour en revenir au Japon, j'y suis allé l'an dernier, j'avais emmené mon 5D MKII avec le 24-105, le 17-40 et le 70-200 f4.

Eh bien, le 24-105 aurait pu suffire, j'ai fait 95% de mes photos avec, et les 5% restants n'ont rien d'inoubliable.
Le 17-50 pourrait donc suffire, tu risques parfois d'être un peu court à 50, mais cela ne devrait pas se produire très souvent.

Pour ce qui est des balades (j'ai vu que tu vas passer à Hakone), difficile de sortir des sentiers battus, parce que des sentiers.... ben y'en a quasiment pas !
La forêt est très dense, et je n'ai pas vu la moindre possibilité de s'écarter des routes fréquentées...