J'avais un peu le même soucis que toi avec le 400mm f/5.6 : difficile d'en avoir une de vraiment nette malgré les vitesses d'obturation élevées.
Je ne sais pas si c'est que j'ai plus d'expérience ou si c'est le matos, mais j'ai eu de meilleurs résultats au 300 f/2.8 et 500 f/4, qui ont des autofocus de feu. Faut dire aussi que je suis passé du 40D au 7D, là aussi l'AF est passé à la vitesse supérieure...