perso j'ai les 2, 40D et 5D et fait pas mal d'animalier avec les 2.
je préfère le 5D pour sa qualité d'image, son viseur et la précision de son AF sur les sujets fixes.
je préfère le 40D pour sa rafale, son AF AI-Servo sur sujets rapides (quoique j'utilise assez peu ce mode) et son crop pour sujets lointains.

bref pour la qualité d'image pure je prend le 5D, mais si je sais que je vais être loin ou que j'aurais besoin d'une grosse rafale je prend le 40D qui me sert de multiplicateur de focale en gros