Tout d'abord merci pour vos réponses rapides.
@ mnemmeth : les leds sont a priori constantes au niveau de la lumière délivrée (mais comment vérifier ?).
combinaison ouverture / vitesse : déjà testée, cela ne change pas le problème, mais je ne suis pas allé dans des valeurs élevées (pas plus de 1/25) niveau vitesse
raw : j'aimerais éviter d'aller par là (temps de traitement nettement plus long et difficilement automatisable), mais si cela permet de faire mieux c'est la prochaine étape que je vais tester.
source de courant stabilisée : je vais me renseigner, je ne sais pas.

@ bird : la cage est "maison" : cube posé sur une table, fermée sur 4 côtés par parois blanches, ouverte au 2/3 sur le dernier côté pour disposer les objets (fruits). 4 spots aux 4 angles de la cage pour minimiser les ombres de la scène. Tu penses que le côté ouvert peut provoquer ces variations (la lumière de la pièce étant un double néon), malgré une faible incidence sur la luminosité de la scène ?

@ celestyx : comme pour mnemmeth je vais essayer d'aller vers des valeurs plus longues d'exposition.
Sur l'ouverture de l'objectif je ne comprends pas trop ce qu'il faut faire tourner : le fut ? la bague de mise au point ? Sur le compact cela ne devrait pas changer non ?
sur le raw cela me semble être une bonne piste, je vais essayer.
Par ailleurs je vais encore faire des tests de lumière pour voir si mes leds ne conviennent pas à mon installation.