J'ai un pc (de bureau) sous win10/Linux et un macbook pro et j'utilise indifféremment mes DD externes (WD my passport) et mes clés usb qu'ils soient en ntfs ou fat.

Pour le NTFS, j'ai tout simplement activé (gratuitement) l'écriture NTFS (sous El Capitan). Le seul reproche est qu'il est un peu lent en écriture, mais sinon ça fonctionne très bien (je n'ai pas noté de différence significative en vitesse d'écriture avec les disque en fat)
Un tuto très simple est disponible : NTFS El Capitan (OS X 10.11) : activer l'écriture - MacPlanete