Etrange, je n'ai pas ce souci. Avec des fichiers venant du 5D et du MkIII (entre 7 et 13Mb selon la photo) je ressort en avec des JPEG (300 dpi - Compression 100 - Format original) avec des tailles allant de 3 à 5mb.

Vérifie bien tes paramètres de sortie. Il doit y avoir quelque chose que tu as publié.