Une photo "redressée" par l'appareil l'est avant le codage en jpg.
Le codage jpg détruit une partie plus ou moins grande de l'information en fonction du paramêtre de compression.
Quand tu redresses une photo jpg, elle va de nouveau être recompressée en jpg et les défauts générés par cette nouvelle compression vont s'ajouter aux précédents.
Sauf si tu modifies avec ZoomBrowser qui ne "redresse" qu'en apparence mais la photo ouverte avec un autre logiciel reste dans son sens d'origine !

En raw, pas de problème puisque le redressement sera antérieur à la compression.

Par principe, si en jpg, mieux vaut le redressement automatique sur le boitier.
En raw, aucune importance.