L'EOS 50D hérite de la totalité de la structure de l'EOS 40D: de ses coques externes à sa cage reflex recevant exactement les mêmes moteurs et obturateur.

Il n'y a que la carte-mère, et le capteur qui changent.

Touts les éléments mécaniques et électromécaniques demeurent inchangés, à une exception près: le mode de fixation du capteur et le réglage du tirage mécanique et de sa planéité.