Dans tes exifs, le temps de pose diminue?
A mon avis tu as un problème soit sur l'intervallomètre (ou sur sa configuration...peut être que progressivement, au fil des poses, ton temps de repos diminue pour finir par manger ton temps d'expo), soit sur ta carte mémoire. Ou alors tu as une fonction réduction de bruit pose longue qui se met en route?
Sur ma monture de voyage, je laisse 5s entre chaque pose d'une minute, ça fonctionne très bien.
Je n'ai jamais entendu parler d'un problème comme le tien...