@Greedo:
J'avais eu un problème similaire lors de mes débuts avec un 580ex.
En fait cela venait tout simplement de mes réglages de l'appareil... je shootais toujours en rafale est visiblement avec le 50D la recharge du flash sur ce mode ne se passe absolument pas bien.
Test en mode automatique pour voir si le problème persiste.
En espérant avoir été utile à ton problème.