Rien de plus normal, en mode AV le boitier ne voit pas le flash
C'est pourquoi on l'utilise souvent pour le fill in. Ainsi le boitier calcul la bonne exposition pour la scène dans son ensemble, et le coup de flash (à doser) apporte un complément de lumière qui permettra de déboucher un contre-jour sur un visage par exemple.

Sinon je te conseille d'utiliser le mode M sur le boitier et E-TTL sur le flash. Tu choisis donc tes paramètres d'ouverture et de vitesse, le flash apportera alors ce qu'il manque de lumière pour bien exposer la scène.