En fait dans le mode silencieux le miroir bascule plus lentement ....
Donc les conséquences (connues) sont simplement un temps où on est "aveugle" dans le viseur plus important (un p'tit chouilla plus comme dirait l'autre)
c'est surtout au niveau Rafale que cela se sent puisque le mode rafale normal est de 4,5 images / sec , et le rafale silencieux est à 3 images / sec. (pour le 6D)

Pour ce qui est des conséquences liés à des usures mécaniques quelconques, sur le papier il n'est pas censé y'en avoir .. dans la réalité, on a pas encore assez de recul sur le sujet ...