Question pas récente mais j'y réponds car je viens de faire cette opération avec la méthode suivante :

Ouvre la SD sur ton ordinateur après avoir importer toutes les photos qu'elle contient
Supprime le dossier DCIM
Crée un nouveau dossier DCIM dans lequel tu pourras créer de nouveaux dossiers à partir de ton boitier ou directement sur la carte.

Voilà si ça peut servir à quelqu'un d'autre...