Salut,

Voici la méthode (je ne conseille pourtant pas de supprimer les originaux, mais c'est ton choix personnel)
Tu charge tes photos sur Aperture3 (en référencé, bien sur, comme cela tu contrôle le dossiers dans lequel tu vas mettre tes fichiers originaux)
Tu fais tes traitements
Tu exporte ensuite les fichiers traités vers la destination de ton choix
Tu supprime ensuite les photos de ton projet aperture (mise a la corbeille, ou raccourci pomme-delete)
Tu vide ensuite la corbeille (ou raccourci shift-pomme-delete) il te sera proposé de mettre l'original a la corbeille système, tu fais OK.
Ton original est maintenant dans ta corbeille.

Le tour est joué
Cependant, il est toujours bon de garder ses originaux (surtout si tu shoote en RAW)
N'oublie pas de faire l'export, sinon tu n'aura pas de version modifiée et tu aura perdu ton original