Moi aussi des erreurs 99 sont apparues sur 40D tout neuf. Avec objectif sigma et Canon, avec une carte différente.
Ayant cherché j'ai trouvé, mais je ne me souviens plus qui et ou, qui avait le même problème et après avoir désactivé le nottoyage du capteur en auto au démarrage et à l'arrêt, le problème avait disparut.
J'ai fait de même, il n'y avait pas grand risque, et pour le moment plus de problème.