Effectivement, GPHOTO2 est un utilitaire qui ne tourne que sous Linux.
Mais comme je le disais, il est possible d'utiliser un LIVECD, ce qui ne nécessite pas l'installation de Linux.
Il suffit de démarrer le PC avec le LIVECD et on se retrouve avec un environnement LINUX qui nous permet d'utiliser GPHOTO2 pour récupérer le nombre de déclenchements.
Ce n'est, à mon avis, pas très contraignant vu que ce n'est pas une manipulation que l'on fait tous les jours.

@Hitman: Comme l'indique cblo, il faut suivre les indications du manuel.
Mais voici tout de même un petit explicatif :
- Récupérer la version alpha2 de Magic Lantern, ce qui n'est possible qu'après avoir fait un petite et unique donation de 5€.
- Vérifier que le 5D3 est bien à jour avec la dernière version du firmware Canon, à savoir la version 1.1.3
- Copier les fichiers Magic Lantern à la racine de la carte SD ou CF
- Allumer le boîtier, aller dans le menu de mise à jour Firmware et lancer la procédure de mise à jour.
- Une fois la mise à jour effectuée, appuyer sur le bouton corbeille pour activer le menu Magic Lantern.
Il ne s'agit pas d'une vraie mise à jour du boîtier, comme c'est actuellement une version Alpha de ML elle n'est pas permanente.
A l'extinction du boîtier, le firmware ML n'est pas gardé en mémoire.