L'ideal, c'est encore d'avoir les deux!
Le stigmomètre te permet d'avoir un repère visuel sur la "distance" qui reste à parcourir pour avoir le point, et le chip AF permet de gagner en précision.
Pour changer le stigmo sur un 350D, c'est pas compliqué du tout, il suffit juste de ne pas avoir la tremblote. Fait une recherche, plusieurs tutoriaux existent et décrivent la manipulation avec précision. Pour ma part, je dirai qu'il n'y a quasiment aucun risque pour le boitier (je dis quasiment car certaines personnes ont deux bras gauche )
L'autofocus est toujours actif avec les objectifs EF bien sûr, mais les points rouges n'apparaissent plus dans le viseur (350D/400D).