J'ai fait pas mal de photos en église avec un Canon 24-105L IS et un Tokina 12-24 f/4.

Le 24-105 est formidable grâce à la stabilisation, mais avec le Tokina on s'en tire bien en montant en ISO et en prenant un appui (pilier, chaise...). Je n'ai qu'un EOS 20D, mais je suis surpris par la qualité des photos en 800 ISO (voire en 1600 ISO), et j'hésite de moins en moins à monter les ISO, car je fais rarement des tirages de 3x2 mètres et jusqu'à 20x30cm ça reste correct. En tout cas c'est mieux qu'avec les pellicules 1600 ISO que j'utilisais à une époque!

Si tu as la chance de pouvoir utiliser un trépied, pense au HDR, c'est formidable dans ce genre d'endroit, car les vitraux étant beaucoup plus lumineux que le reste de l'église, il n'est pas toujours évident de rattaper convenablement la sur- ou sous-exposition au post-traitement.