Pour répondre (en partie) à la question de départ :

Les micro-ajustements sont enregistrés dans le firmware de l'objectif donc quelque soit le boitier qui l'utilise l'objectif appliquera ses ajustements.
En gros ces ajustements sont une correction de la distance de déplacement du focus qui est envoyée par le boitier à l'objectif.

Quand à savoir si l'objectif applique ou non cette correction quand le boitier est en live view, je n'en sais rien mais je doute que le boitier envoie cette information à l'objectif.
Ca doit pouvoir se vérifier assez facilement sur le terrain. Par exemple, si l'objectif applique une correction de front-focus en AF "standard" et que le boitier est en AF "live view" ça devrait amener à un back-focus.

A noter que contrairement au discours officiel de canon, les ML (et le live-view des reflex à dual-pixel AF) peuvent aussi être sujets à des problèmes de back ou front-focus liés à l'objectif. Il y a une discussion intéressante sur le sujet sur le forum chassimage en ce moment avec des tests le prouvant.