J'ai le 70-300 depuis ... mon 400D. Ce n'est pas du tout un cul de bouteille: il y a quelques années, on disait même que pour la qualité optique (pas pour la construction!) c'était un L qui ne disait pas son nom.
Bien sûr que le 70-200 est meilleur optiquement; c'est même sûrement le meilleur zoom Canon!
A l'époque, j'avais fait le choix du 70-300 pour plusieurs raisons: son prix (la différence entre les 2 était beaucoup plus importante qu'aujourd'hui), et son poids (utilisation principale en randonnée en montagne). Franchement, il ne m'a jamais déçu, et répond parfaitement à ce que je lui demande. Utilisation préférentielle en paysage et architecture pour les plans rapprochés, et plus occasionnellement pour de l'animalier en billebaude.
Je tire en format A3+, et je mets au défi de trouver quelles photos ont été faites avec lui, ou avec mon 17-55 (réputé excellent)

En résumé, à voir selon les besoins: en qualité pure (optique et construction) le 70-200 est meilleur. Si on a besoin de l'IS, ou du range 200-300, ça se discute

Eric