Salut Poucinette
Les deux objectifs macro que tu cites sont optiquement très bons et se valent. Il y a principalement deux grandes différences entre ces 2 objectifs :

1) La focale :

-> 60mm
+ Focale plus courte, donc moins sensible aux tremblements du photographe.
+ Financièrement plus abordable

- La faible distance de travail au rapport 1:1 (environ 5-6cm entre la lentille frontale et le sujet) limite son utilisation, notamment en ce qui concerne les sujet vivants et craintifs.
- Le bokeh est moins joli à cause de la focale.

->100mm
+ Focale plus polyvalante. Bonne distance de travail d'environ 14cm. C'est généralement un très bon compromis.
+ Le bokeh est plus joli.

- Focale plus longue, donc plus sensible aux tremblements du photographe.
- Plus cher.

2) La monture :

Le 60mm est EF-s, ce qui signifie qu'il ne pourra pas se monter sur un boitier avec capteur 24x36. Le 100mm est un EF, donc pas de problème de compatibilité.

Pour le bokeh, un comparatif pour te donner une idée (source):



Globalement, j'aurais tendance à te conseiller le 100 macro, mais il coûte plus cher.