Avec Lightroom tu peux aussi renommer directement les fichiers comme tu le souhaites.
Sinon, pourquoi ne pas simplement les mettre dans un dossier différent ou forcer la numérotation d'un des appareils (remise à zéro) ? Bon forcément si les deux sont neufs....

Sur Linux et Mac ou n'importe quel autre shell UNIX :
for photo in *.CR2; do mv $photo EOS7D_$photo; done

Y'a des raccourcis possibles, je sais, mais ce n'est pas standard, ça dépend selon que tu utilises bash, zsh, ksh, etc.

Tu peux aussi faire plein d'autres transformations, telles que reprendre la date/heure ou une information EXIF ou n'importe quoi d'autre. Je veux bien aider si quelqu'un a besoin de ça.

Sur Mac, il y a possibilité de créer une action Automator.
Ensuite il n'y a plus qu'a faire un glisser-déposer des photos concernées par exemple et elles sont automatiquement renommées.
Avec Gnome, on peut aussi faire un script nautilus (que j'utilise sans modération ! C'est très pratique ces trucs-là !)