Il n'y a aucun problème à désinstaller iPhoto. Si, comme je le suppose, tu as importé les éventuelles photos de iPhoto dans Aperture, ça ne posera pas de problème.
Tu prends iPhoto et la ou les bibliothèque(s) iPhoto que tu mets à la corbeille. Ce que je te conseille toutefois, c'est de ne pas vider la corbeille avant d'avoir redémarré et t'être assuré que toutes tes photos se trouvent bien dans Aperture.