Je viens de lire le chapitre consacré à la fonction export dans le bouquin de Martin Evening (Photoshop Lightroom 5 Book)
Votre cas précis n'est pas décrit, le bouquin parle de l'export entre deux ordinateurs.
Mais il me semble comprendre que ce que vous décrivez est un comportement normal si Lightroom observe des différences dans la structure du catalogue.
Ce que je viens d'écrire n'est pas bien clair....

Eviter ce comportement: Créer un catalogue spécifique à vos images JPG

Vous pourriez poser la question sur le forum "utiliser lightroom" si ce dernier est toujours en action.
Une autre possibilité serait de poser la question à Jean-Claude Vallot Mon Bric à Brac Photo » Un site à mon image!
Sinon il faudra aller faire un tour sur les sites en langue anglaise