Effectivement, je ne savais par où commencer.
Alors mon catalogue est organiser de telle manière:
Photos/2010/2010_xx_xx

Lorsque je parlais de quelques bêtises durant les importations, elles étaient en fait:
+ un doublon du dossier 2010
+ et quelques dossier 2010_xx_xx dans photos/

J'ai fait toutes les modifications possibles de Lr, c'était quand il existait un seul dossier 2010_00_00 dans tous les sous dossiers de /photos/... Je n'ai pas réussi à faire les fusions depuis Lr donc j'ai commencé petit à petit à côté en essayant de ré-associer les dossiers manquants à peu près en même temps.
Jusque là tout était cool, mais d'un coup Lr n'a plus reconnu aucun fichier. j'ai fait une importation du dossier général /photos, il a récupéré 90% des photos,la liste des mots clés mais avec de tristes 0 à côté.

Il me faudrait peut être le moyen de "rechercher les fichiers manquants" à l'image du browser ou quelques choses de similaire. Cela fait seulement un mois et demi que je l'utilise mais ce serait tellement cool que je puisse récupérer ces heures de classements !