Si tu vois les vignettes, c'est que les photos sont dans ton catalogue et référencées dans la partie "Dossiers" (par contre, elles n'y sont peut être plus).

Un "?" s'affiche-t-il sur ces photos ?
As-tu essayé le menu : "Afficher dans l'explorateur" ? (pour vérifier l'emplacement mémorisé par LR).

Cela pourrais te donner une idée certaine de l'endroit où sont mémorisés tes photos.

Le principal étant d'avoir les photos de côté.

Une idée pouvant être de :
1. supprimer les photos (physiquement) de l'endroit (dossier de ton disque dur)
2. faire une synchronisation (il devrait te proposer de supprimer les photos - a priori tu as déjà du faire cette manipulation)
3. vérifier qu'elles ne sont plus dans ton catalogue (plus d'images ou vignettes grises)
4. faire une "optimisation de ton catalogue"
5. et quitter LR

Il faudrait peut être aussi supprimer les "aperçus" si ils ont été créé, il y a peut être une désynchronisation qui pose soucis, il est possible de supprimer ces dossiers "nop-de-ton-catalogue Previews.lrdata", en ce qui me concerne et par prudence, je me contente de déplacer ... au cas où !

Une fois ces manipulations faites, tu devrais pouvoir ré-ouvrir ton catalogue et les photos qui posent problèmes ne devraient plus exister dedans.

Ensuite, tu devrais (j'espère) pouvoir refaire une importation de tes photos (depuis ta carte ou un emplacement de ton disque dur.

Une autre piste pouvant être d'exporter ton catalogue et de le recréer, cela aura peut être l'avantage de repartir sur une base propre.