C'est normal, tout logiciel de traitement des RAW prend en compte les paramètres de balance des blancs de l'appareil pour caler son réglage de départ.

En gros, l'appareil stocke le RAW et les valeurs de BB.
Le logiciel lit le RAW et les valeurs et les traduits dans son référentiel pour les utiliser.
(les valeurs numériques peuvent être différentes de celles de Canon, et de même, la colorimétrie sera différente).

Tu verras, si tu ne mets la même valeur de BB sur les deux photos, la teinte sera la même.

Ce que fait Lightroom, comme les autres programmes, c'est que pour donner une image, il a :
- les données brut (le fichier RAW)
- les paramètres de développement (BB et compagnie, expo etc...)
Et à l'aide de ses algorithmes, il traite le fichier pour donner un fichier image.

Il y a donc forcément des paramètres de développement.
Les paramètres de départ, dans un soft de RAW, ne constituent pas des valeurs "sans retouche" ou "sans traitement" (ça n'existe pas pour un RAW), mais juste des valeurs par défaut des paramètres.
Si tu changes la BB, ton fichier n'est pas plus "retouché" qu'avec les paramètres par défaut du logiciel.

La plupart des logiciels choisissent d'utiliser les paramètres de balance des blancs de l'appareil comme paramètres par défaut, parce que très souvent ça facilite la vie, et que de toutes façons on peut toujours revenir à autre chose.