Dans le mode bibliothèque, tu choisis l'onglet "Dossier" (dans le paneau de gauche). Sur les répertoires qui apparaissent avec un point d'interrogation, tu clic droit pour faire apparaitre le menu contextuel et désigner le nouvel emplacement.
Comme dit par Gparedes, pour éviter ces désagréments, il vaut mieux gérer ses dossiers photos (renomage, géplacement, etc) depuis LR plutôt que depuis l'explorateur de ton OS.