Ma maigre contribution :
Je suis passé, avec le plus grand bonheur de iVMP (mac) à Lightroom (mac). Non seulement je le trouve plus beau (c'est hyper subjectif, mais assumé), moins typé PC, mais en plus, il m'a ouvert pendant la période de test les voies de la dérawtisation dont je ne me passe désormais plus.
Quant à ton interrogation, et bien qu'il me manque le vocabulaire de geek, les 2 logiciels créent en fait des alias de tes photos, si bien que tu ne touche (et il ne touche) pas à tes dossiers, sauf dans les fonctions de gestion directe des dossiers (déplacement, suppression etc).
En fait dans tout l'onglet collections (sur ivmp et lr), les clichés ne sont que des "renvois", et donc peuvent être moultes fois représentés dans des collections diverses (suis je clair ?).
Bon en clair, jette toi sur LR !