La "philosophie" de Lightroom c'est de n'avoir qu'un seul catalogue.
Le catalogue est une base de données regroupant toutes les informations sur les photos et sur toutes les modifications effectuées.
Il n'y a aucune justification à supprimer des photos du catalogue, le gain d'espace étant relativement minime.
Si vous avez l'intention de passer à LR4, profitez en pour tout regrouper sur un seul catalogue.
Et surtout, n'oubliez pas les sauvegardes