Lightroom sauvegarde les modifications dans son catalogue et - si tu lui demandes - dans un fichier .XMP associé à chaque photo. Ce fichier .XMP est alors mis dans le même répertoire que la photo.
Dès lors que tu travailles avec LR, je te recommande vivement de manipuler tes fichiers (déplacements, suppression, renomage, etc.) depuis LR et non avec l'explorateur de Windows. LR s'occupera de tout, y compris de mettre à jour les liens dans sont catalogue. Tu n'auras pas à te poser le genre de question que tu te poses !