Avant de continuer, je me permet une petite remarque : si un jour tu veux utiliser les dossiers pour leur ordre chronologique, il vaut mieux toujours faire : année-mois-jour. Dans ton cas cela donnerait :

*2005
**2005-01
***reportage xx...
***reportage yy...
**2005-02

Comment as-tu procédé pour ta réorganisation ?

Pour éviter les problèmes de catalogue, tu peux renommer tes répertoires dans LR.

Si tu as modifié tes répertoires en dehors de LR, va voir les vidéo de ouiouiphoto, et prend le déplacement de catalogue. C'est très bien fait.