Salut Julien.
Je suis pas un super pro de PS. Par contre j'ai le sentiment que par principe tous les calques font la même dimension que le calque 'fond'.
Dans la mesure où tu veux 'récupérer' un morceau de ton premier calque : tu selectionne la partie qui t'intéresse (quel que soit l'outil de selection) , tu fais un copier (et non pas nouveau calque par copier), dans le menu fichier tu fais nouveau, et tu colle ta selection dans la nouveau fichier (et non pas calque).
Espérant t'aider.
Philippe

[edit] y'en a qui tapent plus vite que moi.