Je ne suis pas expert, j'ai juste fait quelques essais mais voici quand même mon avis.
Je crois que Photomatix permet le réalignement.
J'ai tenté une fois de modifier l'expo d'une seule prise de vue (en raw). J'ai sous-exposée et sur-exposée la photo en jouant avec le curseur Luminosité sous DPP, j'ai sauvegardé les 3 versions en jpeg que j'ai traité ensuite sous photomatix.
Je n'ai pas été convaincu du résultat.
Je crois qu'il préférable de bracketer à la prise du vue.