OK, je viens de retenter le coup et ça fonctionne à nouveau. C'est semble-t-il une affaire de nom de fichier. Avec le traitement par lot, pas moyen de remplacer des Jpeg existants (quand on a shooté en Raw+Jpeg) par des Jpeg générés par la conversion de fichiers Raw, alors que ce remplacement s'effectue sans difficulté quand on enregistre et qu'on convertit un Raw après l'autre (en traitement individuel).
Si on veut enregistrer Raw et nouveaux Jpeg dans un même dossier il faut effacer tous les Jpeg originels, avant de commencer le traitement par lot.
La solution de Yohann10 qui consiste à enregistrer les nouveaux Jpeg dans un nouveau dossier marche sûrement aussi.

Merci donc à Yohann. Et je tâcherai de réfléchir un peu plus avant de poser une question sur le forum la prochaine fois...