Oui je pense que tu te prend la tête en effet , ton rushe en 50fps sera converti en 25fps si tu bosses sur une composition à 25fps, ou bien si tu exportes en 25fps.

Il n’y aura pas de problèmes particuliers, juste que t'auras une intervalle de frames en moins. Mais t'as raison de te poser la question ceci dit.

Il faut juste décider en amont sur quelle base de fps sera programmé ton projet pour l'export final. Ça se décide donc avant les prises de vue pour une question de cohérence et parti prit.
Dans la plupart des cas c'est 24fps. Mais rien empêche d'utiliser des rushes de 120 à 1000fps dans ton projet à 24fps. C'est sur que si t'en fait pas du slowmo et que le shutter est plus rapide que sur tes rushes de base en 24fps, ça sera pas très esthétique et inutile.