Ce n'est pas un problème de fréquence, ça n'a absolument rien à voir.
Votre boitier filme dans la fréquence que vous définissez, il n'a pas de fréquence par défaut...

Si vous filmez un écran de TV allumé, un moniteur ou un Néon allumé en : Pal à 24p 25p et en NTSC à 30p vous aurez des problèmes de fréquence liés effectivement aux fréquences de rafraichissement (50Hz europe et 60Hz US).
Faites le test...
Mais votre problème c'est autre chose, ça n'a rien à voir.

Je vous repose donc la question :

Cet effet apparait-il sur l'écran de votre boitier ?

Postez le fichier original et non un fichier encodé, car c'est à l'encodage que le problème doit apparaitre.

Si la composition de cotre TIME-Line n'est pas réglée sur les mêmes paramètres que le plan tourné!
Exemple :
Votre plan a été tourné en 24p, votre Time-line est à 25p ou en 30p...
Idem à l'envers : plan tourné à 30p et Play en 25P...
Lorsque vous allez faire Play, vous allez voir cet effet de rafraichissement....

Donnez-moi à nouveau tous les réglage de votre boitier lorsque vous avez fait ce plan :
1) Shutter :
2) Cadence d'image :
3) Pal ou NTSC :
4) Idem pour les réglages de votre Time-Line

Deuxième question :
Dans quel logiciel éditez-vous pour l"encodage / montage ?

Fran6