Ton problème peut avoir 2 origines à mon sens :

1) As-tu installé le codec DNxHD ? Ici => Avid QuickTime Codecs LE> En effet le container est bien "Quicktime" donc .mov, mais le codec est spécifique, il faut l'installer.

2) Si tu as tourné en 24p ou 25p tu dois impérativement choisir la même fréquence d'image de NDxHD, il n'y aura pas d'interprétation sans bug avec DNxHD.