Il y a FormatFactory en gratuit qui le fait quoique j'utilise un autre logiciel payant. Mais avec ces petits outils, il est rare qu'on n'ait pas de problème avec la HD, en particulier désynchronisation du son.
Très commode pour faire des changements de format, comme son nom l'indique. On peut aussi couper le début et la fin (pas précis et même risque de pb avec le son), extraire le son etc.