En fait la différence est vraiment minime, presque imperceptible visuellement...
Quel soit le choix, c'est juste la compression qui change...
Votre ordinateur et votre logiciel de montage vont simplement moins ramer pour afficher la vidéo, car il ne seront pas obligés de décompresser l'image en temps réel.

Pour obtenir la "meilleure" qualité d'image, choisir "Intraframe" sur le boitier, sachant qu'il faudra une carte qui accepte le flux et que ça prendra plus de place pour la même durée d'enregistrement.
> Rien ne change dans FCP !

En revanche :
1) pour les vidéos avec des mouvements très rapides l'image, la vidéo sera plus fluide en lecture !
2) si vous souhaitez réaliser des ralentis en post-production, il est impératif de choisir "Intraframe" sur votre boitier pour obtenir la meilleure qualité d'image (surtout avec les logiciels qui font de la "ré-interprétation d'image" type Twixtor)

Fran6