Oui et ça me parait malheureusement normal... Même si c'était sur des Sigma, qui sont bien connus pour poser plus de problèmes, mais c'est bien le cas avec mon 5D MkII.
Je suis sûr que ça ne vient pas du 5D MkII puisque j'avais le même problème sur le 50D.
En fait, si tu voulais bien faire, il faudrait un MR par focale et distance de focus. Ce qui donne beaucoup de point et beaucoup de boulot. Et ce n'est pas prévu dans les menus Canon.
Ca fait un moment que je compte me pencher sur Magic Lantern, mais je ne suis pas sûr qu'il fasse mieux sur ce point.

Perso, j'ai fait le MR sur la distance la plus proche que j'utilise habituellement avec l'objectif. Vu que la PDC augmente avec la distance de mise au point, quand tu t'éloignes de ta distance de réglage, ça aide, mais ce n'est pas parfait .