Le jpg inclus dans le raw n'est que la vignette, justement, pas la photo pleine taille.

Tes disques externes sont des videurs de carte, ou bien des disques ou tu a copié tes photos à l'aide d'un PC?

Perso, je ne fait pas trop confiance au videurs de carte, on entends trop souvent des mésaventures comme la tienne.
Par contre, quand tu dit sur 2 disques: est-ce une copie en double, que tu avais faite, et si oui, est-ce que ce sont les mêmes photos qui sont corrompues?

Si oui, c'est plutot la source que je mettrais en doute, à savoir la carte.

Pour info, les logiciels de recovery ne pourront rien pour tes fichiers: ils servent à récupérer des fichiers effacés, mais je n'en connait aucun qui soit capable de réparer un fichier corrompu.